Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A3R1O14745 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A3R1O14745 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A3R1O14745 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A3R1O14745 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A3R1O14745 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC9A3R1O14745 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A3R1O14745 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms