Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPEO14579 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPEO14579 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPEO14579 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COPEO14579 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPEO14579 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPEO14579 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPEO14579 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPEO14579 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPEO14579 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPEO14579 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPEO14579 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPEO14579 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPEO14579 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPEO14579 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPEO14579 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPEO14579 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPEO14579 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPEO14579 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPEO14579 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPEO14579 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPEO14579 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COPEO14579 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPEO14579 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPEO14579 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPEO14579 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPEO14579 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COPEO14579 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPEO14579 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPEO14579 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPEO14579 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPEO14579 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPEO14579 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPEO14579 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPEO14579 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPEO14579 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPEO14579 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPEO14579 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPEO14579 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPEO14579 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COPEO14579 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPEO14579 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPEO14579 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPEO14579 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPEO14579 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPEO14579 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COPEO14579 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPEO14579 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPEO14579 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPEO14579 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPEO14579 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPEO14579 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPEO14579 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPEO14579 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPEO14579 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPEO14579 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COPEO14579 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPEO14579 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPEO14579 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPEO14579 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPEO14579 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPEO14579 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPEO14579 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPEO14579 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPEO14579 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPEO14579 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPEO14579 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COPEO14579 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPEO14579 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPEO14579 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPEO14579 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPEO14579 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPEO14579 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPEO14579 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPEO14579 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COPEO14579 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPEO14579 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPEO14579 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPEO14579 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPEO14579 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPEO14579 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPEO14579 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPEO14579 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPEO14579 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPEO14579 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPEO14579 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPEO14579 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPEO14579 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPEO14579 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPEO14579 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPEO14579 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COPEO14579 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COPEO14579 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPEO14579 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPEO14579 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPEO14579 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPEO14579 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPEO14579 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPEO14579 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPEO14579 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms