Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CUX2O14529 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CUX2O14529 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CUX2O14529 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CUX2O14529 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CUX2O14529 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CUX2O14529 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
CUX2O14529 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.56
CUX2O14529 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
CUX2O14529 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
CUX2O14529 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
CUX2O14529 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CUX2O14529 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CUX2O14529 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
CUX2O14529 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CUX2O14529 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CUX2O14529 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CUX2O14529 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CUX2O14529 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CUX2O14529 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
CUX2O14529 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC43.53■■■■■ 4.56
CUX2O14529 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CUX2O14529 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CUX2O14529 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CUX2O14529 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
CUX2O14529 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
CUX2O14529 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CUX2O14529 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CUX2O14529 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
CUX2O14529 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
CUX2O14529 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
CUX2O14529 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CUX2O14529 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CUX2O14529 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CUX2O14529 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CUX2O14529 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
CUX2O14529 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CUX2O14529 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CUX2O14529 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CUX2O14529 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CUX2O14529 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CUX2O14529 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CUX2O14529 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
CUX2O14529 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CUX2O14529 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CUX2O14529 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CUX2O14529 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
CUX2O14529 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
CUX2O14529 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CUX2O14529 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CUX2O14529 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CUX2O14529 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CUX2O14529 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CUX2O14529 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CUX2O14529 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CUX2O14529 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CUX2O14529 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CUX2O14529 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CUX2O14529 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CUX2O14529 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CUX2O14529 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CUX2O14529 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CUX2O14529 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CUX2O14529 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CUX2O14529 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CUX2O14529 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CUX2O14529 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CUX2O14529 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CUX2O14529 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CUX2O14529 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CUX2O14529 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CUX2O14529 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CUX2O14529 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CUX2O14529 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CUX2O14529 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
CUX2O14529 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
CUX2O14529 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
CUX2O14529 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CUX2O14529 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CUX2O14529 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CUX2O14529 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
CUX2O14529 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
CUX2O14529 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
CUX2O14529 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.52
CUX2O14529 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
CUX2O14529 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
CUX2O14529 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CUX2O14529 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CUX2O14529 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CUX2O14529 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CUX2O14529 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CUX2O14529 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CUX2O14529 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CUX2O14529 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CUX2O14529 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CUX2O14529 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CUX2O14529 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
CUX2O14529 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
CUX2O14529 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CUX2O14529 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
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