Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PODXLO00592 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PODXLO00592 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PODXLO00592 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PODXLO00592 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PODXLO00592 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXLO00592 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXLO00592 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXLO00592 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXLO00592 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXLO00592 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXLO00592 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXLO00592 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXLO00592 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXLO00592 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXLO00592 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXLO00592 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXLO00592 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXLO00592 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PODXLO00592 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PODXLO00592 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PODXLO00592 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXLO00592 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXLO00592 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXLO00592 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXLO00592 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXLO00592 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXLO00592 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXLO00592 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXLO00592 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXLO00592 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXLO00592 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXLO00592 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXLO00592 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXLO00592 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXLO00592 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXLO00592 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXLO00592 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXLO00592 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXLO00592 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXLO00592 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXLO00592 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXLO00592 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXLO00592 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXLO00592 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXLO00592 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXLO00592 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXLO00592 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXLO00592 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXLO00592 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXLO00592 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXLO00592 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXLO00592 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXLO00592 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXLO00592 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXLO00592 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXLO00592 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXLO00592 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXLO00592 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PODXLO00592 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXLO00592 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXLO00592 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXLO00592 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXLO00592 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXLO00592 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXLO00592 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXLO00592 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXLO00592 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXLO00592 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXLO00592 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXLO00592 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXLO00592 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXLO00592 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXLO00592 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXLO00592 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXLO00592 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXLO00592 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXLO00592 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXLO00592 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXLO00592 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXLO00592 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXLO00592 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXLO00592 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXLO00592 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXLO00592 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PODXLO00592 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PODXLO00592 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PODXLO00592 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PODXLO00592 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PODXLO00592 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PODXLO00592 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PODXLO00592 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PODXLO00592 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PODXLO00592 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PODXLO00592 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PODXLO00592 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PODXLO00592 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PODXLO00592 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PODXLO00592 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PODXLO00592 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms