Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLIC1O00299 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIC1O00299 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.2 ms