Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD9O00233 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD9O00233 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD9O00233 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD9O00233 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD9O00233 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms