Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARVCFO00192 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARVCFO00192 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ARVCFO00192 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARVCFO00192 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARVCFO00192 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARVCFO00192 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARVCFO00192 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARVCFO00192 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARVCFO00192 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARVCFO00192 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARVCFO00192 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARVCFO00192 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARVCFO00192 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARVCFO00192 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARVCFO00192 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARVCFO00192 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARVCFO00192 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARVCFO00192 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARVCFO00192 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARVCFO00192 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARVCFO00192 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARVCFO00192 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARVCFO00192 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARVCFO00192 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARVCFO00192 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARVCFO00192 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARVCFO00192 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ARVCFO00192 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARVCFO00192 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms