Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNAP23O00161 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SNAP23O00161 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SNAP23O00161 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SNAP23O00161 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SNAP23O00161 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNAP23O00161 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms