Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KT08 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KT08 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KT08 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KT08 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KT08 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KT08 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KT08 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KT08 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KT08 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KT08 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KT08 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KT08 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KT08 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KT08 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KT08 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KT08 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KT08 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KT08 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KT08 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KT08 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KT08 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KT08 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KT08 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3KT08 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3KT08 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3KT08 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3KT08 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3KT08 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3KT08 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3KT08 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3KT08 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3KT08 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3KT08 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3KT08 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KT08 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KT08 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KT08 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KT08 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KT08 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KT08 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KT08 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KT08 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KT08 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KT08 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KT08 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KT08 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KT08 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KT08 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KT08 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KT08 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3KT08 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KT08 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KT08 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KT08 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KT08 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KT08 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KT08 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KT08 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KT08 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KT08 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KT08 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KT08 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KT08 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KT08 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KT08 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KT08 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KT08 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KT08 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KT08 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KT08 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KT08 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KT08 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KT08 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KT08 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KT08 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KT08 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KT08 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KT08 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KT08 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KT08 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KT08 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KT08 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KT08 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KT08 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KT08 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KT08 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KT08 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KT08 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KT08 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KT08 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KT08 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KT08 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KT08 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KT08 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KT08 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KT08 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KT08 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KT08 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KT08 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms