Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
H7C1D1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
H7C1D1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
H7C1D1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
H7C1D1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
H7C1D1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
H7C1D1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
H7C1D1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
H7C1D1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
H7C1D1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
H7C1D1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
H7C1D1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
H7C1D1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
H7C1D1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
H7C1D1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
H7C1D1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
H7C1D1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
H7C1D1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
H7C1D1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
H7C1D1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
H7C1D1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
H7C1D1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
H7C1D1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
H7C1D1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
H7C1D1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
H7C1D1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
H7C1D1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
H7C1D1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
H7C1D1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
H7C1D1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
H7C1D1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
H7C1D1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
H7C1D1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
H7C1D1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
H7C1D1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
H7C1D1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
H7C1D1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
H7C1D1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
H7C1D1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
H7C1D1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
H7C1D1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
H7C1D1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
H7C1D1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
H7C1D1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
H7C1D1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
H7C1D1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
H7C1D1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
H7C1D1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
H7C1D1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
H7C1D1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
H7C1D1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
H7C1D1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
H7C1D1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
H7C1D1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
H7C1D1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
H7C1D1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
H7C1D1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
H7C1D1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
H7C1D1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
H7C1D1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
H7C1D1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
H7C1D1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
H7C1D1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
H7C1D1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
H7C1D1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
H7C1D1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
H7C1D1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
H7C1D1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1D1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1D1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1D1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1D1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
H7C1D1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
H7C1D1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
H7C1D1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
H7C1D1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
H7C1D1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
H7C1D1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
H7C1D1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
H7C1D1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
H7C1D1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
H7C1D1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
H7C1D1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
H7C1D1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
H7C1D1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
H7C1D1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
H7C1D1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
H7C1D1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
H7C1D1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
H7C1D1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
H7C1D1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
H7C1D1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1D1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1D1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1D1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1D1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1D1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1D1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1D1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1D1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms