Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LMO7DNF2Z398 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO7DNF2Z398 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO7DNF2Z398 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms