Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB8E9PQR5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB8E9PQR5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms