Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP99D6REC4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP99D6REC4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP99D6REC4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms