Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HHLA1C9JL84 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HHLA1C9JL84 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HHLA1C9JL84 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.8 ms