Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRDCB7Z8K6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRDCB7Z8K6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRDCB7Z8K6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRDCB7Z8K6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRDCB7Z8K6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRDCB7Z8K6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRDCB7Z8K6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRDCB7Z8K6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRDCB7Z8K6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRDCB7Z8K6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRDCB7Z8K6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRDCB7Z8K6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms