Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDZK1P1A8MUH7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZK1P1A8MUH7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms