Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC154A6NI56 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC154A6NI56 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC154A6NI56 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 755.4 ms