Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00862A6NCI5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00862A6NCI5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms