Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XIRP2A4UGR9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XIRP2A4UGR9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XIRP2A4UGR9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XIRP2A4UGR9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms