Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms