Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKIP1Q9NQ31 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms