Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL7

WDR12, Ribosome biogenesis protein WDR12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR12Q9GZL7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR12Q9GZL7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR12Q9GZL7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms