Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLDIP3Q9BY77 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLDIP3Q9BY77 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLDIP3Q9BY77 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLDIP3Q9BY77 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLDIP3Q9BY77 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLDIP3Q9BY77 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLDIP3Q9BY77 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms