Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC41A2Q96JW4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms