Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTV1Q96GA3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTV1Q96GA3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms