Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms