Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms