Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms