Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms