Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms