Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms