Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms