Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms