Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP7Q16576 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms