Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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