Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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CDH18Q13634 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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