Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTMR3Q13615 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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