Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RPS14-207ENST00000521466 592 ntAPPRIS P1 TSL 514.02□□□□□ -0.179e-11■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 RPS14-204ENST00000518139 669 ntTSL 314.01□□□□□ -0.179e-11■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 PSMA4-218ENST00000560099 2596 ntTSL 222.61■■□□□ 1.213e-11■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.053e-11■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.373e-11■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.543e-11■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.643e-11■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 218.86■□□□□ 0.611e-10■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.411e-27■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 NSFL1C-213ENST00000555944 2588 ntTSL 219.54■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.632e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 ARID1A-206ENST00000466382 2699 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-11■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 NSFL1C-204ENST00000461211 3799 ntTSL 57.71□□□□□ -1.172e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)16.55■□□□□ 0.243e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.113e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.633e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-203ENST00000562125 722 ntTSL 215.39■□□□□ 0.053e-8■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 513.8□□□□□ -0.25e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.284e-8■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.834e-8■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.043e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.213e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 RPS3-220ENST00000534555 387 ntTSL 319.63■□□□□ 0.731e-66■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-50■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.373e-50■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.42e-12■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.42e-12■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.152e-12■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.122e-12■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.678e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.68e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 BAX-211ENST00000513545 775 ntTSL 326.5■■□□□ 1.831e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.236e-8■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.862e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.231e-12■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.621e-12■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.331e-12■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.131e-12■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MICALL2-204ENST00000467394 2080 ntTSL 222.2■■□□□ 1.142e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MICALL2-209ENST00000479007 1855 ntTSL 221.82■■□□□ 1.082e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MICALL2-205ENST00000467783 639 ntTSL 321.08■□□□□ 0.972e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MICALL2-206ENST00000470807 668 ntTSL 320.34■□□□□ 0.852e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 219.41■□□□□ 0.72e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 219.27■□□□□ 0.682e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MICALL2-207ENST00000471899 899 ntTSL 219.04■□□□□ 0.642e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MICALL2-214ENST00000493998 404 ntTSL 215.57■□□□□ 0.082e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 214.92□□□□□ -0.022e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.128e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.738e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.873e-34■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 LDHB-201ENST00000350669 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-34■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 LDHB-206ENST00000470985 678 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.013e-34■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 LDHB-209ENST00000542765 672 ntTSL 25.09□□□□□ -1.593e-34■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.242e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.376e-8■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.746e-12■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.552e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.096e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.036e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.016e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 AP1B1-211ENST00000482818 3560 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.36e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 AP1B1-204ENST00000405198 3838 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.476e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.312e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 AHSA1-207ENST00000555473 561 ntTSL 214.62□□□□□ -0.076e-12■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 AHSA1-205ENST00000555133 1048 ntTSL 313.67□□□□□ -0.226e-12■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.972e-15■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.162e-15■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.111e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AC090360.1-202ENST00000562771 1032 ntAPPRIS P5 TSL 428.23■■■□□ 2.111e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.071e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.021e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.532e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.331e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 HDHD5-207ENST00000486462 1591 ntTSL 223■■□□□ 1.271e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.22e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.161e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.152e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.121e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.042e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPNS1-208ENST00000566059 1615 ntTSL 521.12■□□□□ 0.972e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPNS1-211ENST00000568829 780 ntTSL 520.28■□□□□ 0.842e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.712e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 HRAS-208ENST00000478324 631 ntTSL 518.08■□□□□ 0.481e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 HM13-222ENST00000494153 757 ntTSL 517.39■□□□□ 0.371e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.151e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.124e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 RBFA-205ENST00000593019 1551 ntTSL 214.9□□□□□ -0.021e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AC090360.1-203ENST00000591514 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 414.04□□□□□ -0.161e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 HRAS-206ENST00000462734 627 ntTSL 213.97□□□□□ -0.171e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 HDHD5-205ENST00000477157 3614 ntTSL 1 (best)12.62□□□□□ -0.391e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 NFE2L2-211ENST00000464747 2749 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.431e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 CA8-201ENST00000317995 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-9■■■□□ 16.4
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