Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms