Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCG1P45844 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms