Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBRP36941 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBRP36941 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms