Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VCLP18206 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VCLP18206 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VCLP18206 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VCLP18206 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VCLP18206 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VCLP18206 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VCLP18206 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VCLP18206 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VCLP18206 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VCLP18206 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VCLP18206 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VCLP18206 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VCLP18206 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VCLP18206 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VCLP18206 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VCLP18206 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VCLP18206 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms