Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms