Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2P0DI81 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms