Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQ87 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQ87 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQ87 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQ87 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms