Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALD1Q9ULE6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms