Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS45Q9NRW7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS45Q9NRW7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms