Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms