Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms