Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms